生物信息学在鸟类研究中占据主导地位

从生物信息学和基因组数据分析到Python软件, 学生在追求科学事业的过程中获得了提供竞争优势的技能.

2023年3月27日

如果有一个专业的教训 生物化学 23岁的Alex VanHelene少校和 生物学 23岁的马修·希利少校从他们的 斯通希尔大学本科生研究经历(SURE) 这就是适应性的重要性.

“第一次没有什么像预期的那样,希利说。, 谁的SURE参与得到了NSF S-STEM资助. “研究就是解决问题.”

一个恰当的例子是:这两个学生——他们都是通过马萨索伊特社区学院转学计划来到斯通希尔的——在开始之前就不得不转移他们的工作重点. 最初, 他们计划使用结合编程和生物学的生物信息学技术来分析在科德角收集的樱桃面草鹰和红宝石草鹰蜻蜓标本的数据. 研究小组希望确定这些生物是否, 科学家们有时无法区分这两者, 形成杂交或彼此是两个不同的物种. 

数据故障打乱了这些计划. 而不是去年夏天分析蜻蜓, 三人组使用了马达加斯加鸟类的数据 生物学副教授尼古拉斯·布洛克 这是他之前与合作者一起收集的论文资料. 

“尽管新葡萄8883app官网最新版-Apple App Store改变了, 学生们学到了与处理蜻蜓数据相同的生物信息学技术,布洛克说。. “新葡萄8883app官网最新版-Apple App Store正在问关于物种如何杂交的非常相似的问题. 他们希望将来能把他们所学到的应用到蜻蜓的数据中, 即使在SURE结束后.”

玩

生物学专业的Alex VanHelene ' 23解释了他和Matthew Healy ' 23在他们的SURE项目中探索的一些科学概念，以及为什么这是一次宝贵的经历.

数据经验对研究生申请很有价值

希利指出，他在夏季研究经历中磨练出来的技能也将转化为斯通希尔以外的机会. 

“我计划大学毕业后继续读研究生，”这位布罗克顿居民说. “我对生物信息学和基因组数据分析非常感兴趣. 我现在学到的一切都将在未来帮助我以专业的能力追求这些兴趣.”

希利说，SURE让他锻炼了与蟒蛇有关的肌肉, 一种他毕业后可能会继续使用的计算机编程语言. 

“即使蟒蛇消失了, 一种新的编码语言将取而代之, 你可以保证它们会非常相似,他说. “编程语言是这样的，一旦你学会了, 你能以两倍的速度学会另一个，因为它们太相似了.”

一个成长为科学角色的机会

至于布洛克的学生通过SURE磨练出来的软技能, 个人责任感是VanHelene最看重的. 

“我喜欢SURE的一点是，学生们被赋予了很大的自由和责任,他说. “这真的取决于新葡萄8883app官网最新版-Apple App Store保持动力，出现并完成工作. 我很感激. 这个项目是我对现实世界的期望的垫脚石.”

作为VanHelene, 沙伦本地人, 麻萨诸塞州, 考虑离开斯通希尔后的下一步行动, 他希望他能把他在SURE的积极经历传递出去. 

“我的目标是在我离开后对这个项目产生影响，”他说. “马修和我正计划制作一个教程，基本上详细说明新葡萄8883app官网最新版-Apple App Store正在研究的每一步程序. 它将成为布洛克教授实验室未来学生的资源. 我很感激我有机会成为这样的领导者.” 

有关的故事

为你